提起这个问题，就让人想起明朝的锦衣卫、东西厂，尽管历史背景不同，但性质类似。
民国政府，在孙中山时期，提出的纲领口号是“联俄、联共、扶助农工”，俗称“三民主义”。联俄、联共是措施和手段，扶助农工是目的。前两项做到了，后一项没有做到，也很难做到。因为民国政府不是代表老百姓利益的政府。但不管怎么说，孙中山能够提出这样的纲领已经非常不容易了。
到蒋介石脱离武汉国民政府那一天开始，他搞的所谓南京国民政府，其实质，就是蒋家王朝，家天下。这就是我们为什么说蒋介石“叛变革命”的原因。
所谓革命，无非就是推动社会向前发展、进步，而蒋介石却倒行逆施，实行“党国”统治。党，是他一个人的党；国，也是他一个人的国。只要谁和他意见不同，就开除谁的党籍。只要谁和他建国、执政理念不同，谁就是国家的叛徒。
这就是我们过去一直说的“蒋家王朝”。名义上是“民国”，民众的国。其实，是他蒋介石一家的天下。蒋介石死了，其儿子蒋经国继任了。
有人或许会反驳我：“你这是胡扯！蒋经国死了，为什么蒋家王朝没有延续下去呢？”
这是因为国民党去了台湾，其执政基础和环境变了，国民党也衰落了。假如国民党仍然在大陆延续下去它的统治，蒋家王朝一定会一直走下去。
既然是家天下，蒋介石的治党、治国理念就是所有人忠于他一个人。他不希望手下人团结一心，而希望他们各自为政，各怀心腹事，各拉各的调，各吹各的号，只对他一个人负责，只对他一个人忠心。他不相信任何人，猜忌任何人，因此，中统、军统这两个兼收集情报、监视下属、关押处理“不同意见”人士的组织便应运而生。
中统，全称是中国国民党中央执行委员会调查统计局。军统，全称是国民政府军事委员会调查统计局。从字眼上看，这两个组织和特务两字一点都不搭边。这就和当初日军“七三一部队”门口挂着“给水部队”非常相似。挂着羊头卖着狗肉。给人一种极大的欺骗性。就是这种欺骗性，就说明这种组织有问题。
由此，就涉及到一种御人术。这也就说到了题主的问题“为什么同属民国政府，军统和中统会经常内斗”。
在蒋介石看来，军统也好，中统也罢，都是他自己豢养的两条“忠狗”。是狗，就要尽力讨好主子，以得到更多的青睐，得到更多的狗粮。大狗要喂养小狗，小狗要效忠大狗，没有“狗粮”是不行的。那怎么才能得到更多的“狗粮”呢？那就得多叫唤、多跟踪、多咬人。
两条狗在跟踪、咬人的过程中，难免会遇到同一个目标。为了在主子面前得到更多“狗粮”，它们难免会相互撕咬。这就是军统、中统之所以内斗的根本原因。尽管他们两个组织想法、目标是一致的，都是压制打击和蒋介石理念不同的异己分子，清除蒋家王朝的绊脚石，但是，这功劳是谁的，结果也就大不一样了。
中统组织其实成立很早，1928年由CC系分子成立的国民党中央组织部党务调查科，领导人是陈果夫、陈立夫兄弟两。
1938年3月，以军事委员会调查统计局（军统）第一处为基础，成立中国国民党中央执行委员会调查统计局，中统这个名称由此正式形成。
中统局局长由国民党中央党部秘书长兼任，而由副局长负实际责任。陈立夫、张厉生、朱家骅先后担任过局长，徐恩曾、叶秀峰、顾建中，邹学峻、季源溥等先后担任过副局长。
1947年4月，中统改为“党员通讯社”，简称“党通局”。1949年3月，又改为台“内政部调查局”，隶属于台当局行政管理机构。
但军统后来者居上。1931年成立复兴社（蓝衣社）。1932年又在复兴社内设核心组织力行社，设有一个专门进行谍报活动的特务处，它是军统局的最前身，戴笠为处长。
1937年底， 力行社特务处与特工总部（1927年成立之“国民政府军事委员会密查组”）合并，成立“国民政府军事委员会调查统计局”。下辖二处，第一处负责党务，第二处则负责情报，并直接向委员长蒋介石负责。
力行社特务处编为该局第二处。第二处简称“军统”。第一处分离出来，成为“中统”。
军统局后来发展到全国各地几十万人的庞大组织系统，竟然还把手伸到了军队系统，比如抗战时期的“忠义救国军”，就是军统局的直属部队。
军统局正式由1938年成立，1950年解散。早期的领导人为戴笠。军统局的组织形式是局-区-站-组-队，有的地方设有相当区、站的办事处。
也就是说，军统和中统这两个特务组织，曾经有一段时间属于一家，分分合合，但原来最早的主子又各不相同。本来就是各怀心腹事，加上蒋介石委员长的作用，两个组织的内斗是必然的。
眼看着军统借抗战之势，发展越来越庞大，中统越来越没有存在感，蒋介石自然会把天平上倾斜的重量调整一下。
在蒋介石看来，我掌管的全国各地的部队，尽管有几百万，其实，由于各自为政，能够直接调动、指挥的部队却非常有限。而你戴笠手下不仅有五万多人的情报人员，另外还有几十万直接效忠你的精锐部队，这还了得啊？
结果就是抗战结束后第二年戴笠被“摔死”，军统局被降级，由原来的委员长直属，变成国防部下属二厅一个核心组织“保密局”，局长由原军统局戴笠的秘书、办公室主任毛人凤担任。
大家细想一下，是不是这样？
